Естественный процесс, начало которому положило происхождение жизни, а его протекание сопровождается необратимыми изменениями на различных уровнях организации живого (от молекулярного до биосферного), называют эволюцией.

Органы, которые длительное время не функционируют, в ходе эволюции превращаются в рудименты (то есть недоразвитые, потерявшие своё первоначальное значение структуры по сравнению с предковыми формами).

Примером рудиментарных органов являются кости тазового пояса у китообразных. Они подтверждают факт происхождения современных китов, дельфинов от наземных четвероногих млекопитающих.

Сравнительный анализ строения среднего уха у разных групп млекопитающих — сравнительно-анатомический метод, так как он выявляет гомологию органов.

Составление филогенетического ряда лошади — палеонтологический метод, он основан на изучении останков ископаемых форм.

Сравнение кариотипов человека и шимпанзе — молекулярно-генетический метод, он заключается в изучении строения и количества хромосом у близких видов.

Обнаружение у эмбрионов позвоночных на ранних стадиях развития общих признаков — эмбриологический метод, так как основан на исследовании закономерностей эмбрионального развития.